本處於95年訂定發布實行之「墾丁國家公園管理處核發土地使用證明規費收費標準」,每3年依規費法辦理檢討，已凍漲多年，最近檢討考量因成本變動、消費者物價指數上漲及臨近鄉鎮收費標準等因素，原收費每筆土地新臺幣５０元，調整為每筆土地新臺幣１００元，已完成公告程序，並依公告內容收費。
證明書原領取方式採掛號郵寄或由民眾自行領取2種選項，因常有民眾申請後忘記領取情況發生，且於110年度申請方式已新增網路線上申請(核發)功能,故取消申請書民眾自領方式。
申請人只要上本處全球資訊網(https://www.ktnp.gov.tw/，行政服務／土地分區查詢及線上申請系統）網路系統填寫申請資料，並依照流程指引完成繳款後，證明書會以e-mail寄送通知，申請人再依所提供連結下載核發之證明書及電子收據，讓申請及領取更加便利,請多加利用。