經過將近一年的調查，南仁山區水域由水質和土壤因子，包括水中溶氧(D.O.)，生化需氧量(B.O.D5)，酸鹼度，磷酸鹽類、硝酸及亞硝酸鹽類，水中葉綠素a，底泥之磷酸鹽及有機物等因子分析的結果顯示出，它已屬於優養和受污染的水域。在這幾片水域中，以南仁山入口處的宜蘭潭水較深，優養化和污染的程度沒有那麼嚴重。有關造成優養化和污染的原因在文中曾詳細的討論，但主要受該地自然環境的限制、水草的密生、水鳥和水牛的聚集都有密不可分之關係，未來南仁山生態保護區，在經營和管理上可能面對的問題文中亦討論到。
在南仁山水域附近約兩棲類共記錄到有十四種，幾佔台灣產兩棲類的一半。其中腹斑蛙和虎皮蛙是以前國家公園調查所沒有記錄到的。金線蛙可算是水域附近數量最多的青蛙。至於爬蟲類則記錄到有二十四種。在本島排名之五大毒蛇;眼鏡蛇、百步蛇、龜殼花、雨傘節和赤尾青竹絲等都可在水域的附近發現到。又十三種蛇類中之赤背松柏根、紅斑蛇、茶斑蛇、斯文毫氏遊蛇及梭德氏遊蛇等五種對墾丁國家公園而言是新記錄種。至於蜥蜴類則有十一種，其中守宮、半葉趾虎、台灣地蜥、台灣滑蜥、印度蜓蜥和麗紋石龍子等是新增的種類。在此次調查中最重要的是半葉趾虎(Hemiphyllodactylus typus)的發現。這是台灣的新記錄種。針對此豐富的兩棲和爬蟲動物相，管理單位應有完善的管理對策。
計畫類別：[動物生態]
計畫屬性：本處委託研究
執行年度：保3-1
計畫主持人：呂光洋等