國家公園生態保護區 簡介 人類是自然界的一個族群，需要有健全穩定的自然環境與自然資源的供應，才能維持高生活水準，並持續生存與繁衍後代，生態保護區的設定，則是達成上述需求極具效率的方式之一，而為達與自然環境和平共存暨合理利用自然資源，提供學術研究，建立長期生態監測系統，以瞭解自然資源之變遷，乃為生態保護區設立之重要工作之一。 　　本國家公園共劃分陸域生態保護區5處： 分別為香蕉灣、南仁山、砂島、龍坑及社頂高位珊瑚礁（編號自生一至生五），面積共計6218.68公頃，佔陸地面積34.39﹪。 海域生態保護區共4處：（編號自海生一 至海生四） 面積474.72公頃，佔海域計畫總面積3.13％。 陸域生態保護區 生一 　香蕉灣生態保護區 位於船帆石與香蕉灣間之海濱地帶，瀕臨南灣海域，全區均為國有林班地，面積計28.48公頃。擁有珍貴之海岸林及大型高位珊瑚礁岩，富於學術研究及觀賞價值。現有台26號省道從中穿越，分成東西兩部份，因交通便捷，附近又有船帆石聚落，生態資源易遭人力破壞，應加強保護措施。 生二　 南仁山生態保護區 位於計畫區之東北端，東以狹長之海岸地帶瀕臨太平洋，西側約以四十二、四十四、四十五、四十七、四十八、五十六等國有林班地範圍為界，南接佳樂水遊憩區，北面以太平山及其附近之山脊、山溝為界，面積計5587.05公頃。全區之地型地勢大體上以太平山、南仁山、萬里得山、出風山、滿州山、豬月勞束山間之主山脊線向東西兩面傾斜，坡度陡峻，兼備丘陵、山谷、沼潭、溪流、山坡、草原等變化多端之地型地勢。本區由於位置偏僻交通不便罕見人跡，除南山路之窪地南仁湖為管理處管有之外，其餘區域均屬國有林班地，區內有小部份區域已遭濫墾或改植人造林外，多為濃密原始林所覆蓋，其間孕育著上千種植生與各類野生動物，每年十月則有大批灰面鷲在此過境，景觀壯麗。完整之動物相及珍貴之植群，除富於學術研究價值外，並可以供環境教育及景觀欣賞使用，是墾丁國家公園之精華所在。 生三　 砂島生態保護區 砂島海灘，擁有極珍貴的『貝殼砂』，其組成沙粒甚為均勻，係海洋中之貝殼長期受到海水侵蝕，被擊碎研磨而成晶瑩明亮之細沙，隨海流漂洋過海沖至砂島內構成之自然景觀。面積有3公頃。 生四　 龍坑生態保護區 龍坑地區為綿延之群狀珊瑚礁，隔著狹窄的陡坡及懸崖，為隆起之高位珊瑚礁，由於重力及海浪之衝擊，台地崖之珊瑚石灰岩逐步破裂，向下崩落，形成絕佳的崖崩景觀。面積計61.67公頃。 生五 　社頂高位珊瑚礁生態保護區 本區環繞著現有之墾丁國家森林遊樂區，大部份區域為林業試驗所之試驗林地，小部份為國有林班地，面積計有538.48公頃，其地形係由中央高地向四周傾斜之丘陵台地，南面較陡，北面稍緩。全區遍佈古老之高位珊瑚礁岩，生長其上之珊瑚礁植群，榕樹類植物之不定根、熱帶雨林、季風林植群及毛柿母樹林等混合體之景觀，獨具特色，又是各種野生動物生存繁殖之場所。尤其鳥類、蝴蝶、蜥蝪、昆蟲等資源極為豐富，並有罕見的台灣獼猴與黃鸝。因本區未開放參觀，故尚能保持原始自然狀態。

海域生態保護區 海生一 　生態保護區 位於大平頂台地崖西側，下水崛至萬里桐間之海域，海水清澈，海底地形富於變化，巨大礁石林立，間有深溝及裂谷，形成懸崖絕壁、峽谷隧道等奇特景觀。全區遍佈生長良好之各類石珊瑚、軟珊瑚、成叢的海扇、海柳及群游的珊瑚礁魚類等，此外各種貝類及海百合、海藤、海鞭等分布亦多。本區適於潛水活動，東北季風盛行時節，因位居避風地帶，對潛水活動之影響不大，面積計149.06公頃。 海生二 　生態保護區 位於關山高位珊瑚礁岩西側至白砂鼻間之海域，海底景觀雄偉，有石洞、隧道、拱門、峽谷等各種海底地形，且水質清澈，各種石珊瑚、軟珊瑚生長甚密，珊瑚礁魚類、貝類及海百合、海星等均相當豐富。本區適合海底攝影及冬季之潛水活動。面積計63公頃。 海生三 　生態保護區 即船帆石南側經香蕉灣至砂島間之海域，海底地形為狹長帶狀之裙礁而被浪渠或沙溝分隔成許多塊狀珊瑚礁，礁石底質地段，石珊瑚、軟珊瑚之生長良好，呈群聚型態尤其各種蕈狀珊瑚之分布甚多，珊瑚礁魚類、貝類亦很豐富。面積計87.12公頃。 海生四 　生態保護區 即風吹砂以南至龍坑間之海域，海底多大塊礁石、地形富於變化，石珊瑚及軟珊瑚在礁石表面生長，甚為密集，而以軟珊瑚類為主，尤其獨立礁附近，多大型魚類，景觀至為出色，面積計177.91公頃。