其實，以哺乳類動物來說，在墾丁國家公園內，有「森林小精靈」之稱的松鼠，及能翱翔林間的大赤鼯鼠，也頗為常見。其他，像性情溫馴，有果子狸之稱的白鼻心；毛色變化多的台灣野兔；以及附近農民頗感頭痛的山豬，數量也逐漸多了！
根據調查得知，棲息在墾丁國家公園內的哺乳類動物，還有俗稱「羌仔」的麂，這是台灣產三種鹿類中體型最小的種類。另外，這兒也有被稱作「穿山甲」的台灣鯪鯉，以及會放臭屁的鼬　，毛如棕蓑的棕蓑貓和過去毛常被用來製作毛筆的筆貓（麝香貓）。
在台灣，除了住家附近的家蝠之外，其他種類的蝙蝠，已不多見了！但如果走入密林或人跡杳至的巖洞中，一隻隻奇特的蝙蝠，像台灣蹄鼻蝠、渡瀨氏髭蝠，垂掛樹上、洞壁，蔚為奇觀！